Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTBN1Q01082 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SPTBN1Q01082 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms