Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
UBE2NP61088 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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