Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01547P58512 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
LINC01547P58512 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms