Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPHB1P54762 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms