Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ITGA8P53708 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms