Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AP3M2P53677 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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