Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEK3P51956 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEK3P51956 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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