Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMARCA4P51532 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMARCA4P51532 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms