Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACADSBP45954 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ACADSBP45954 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms