Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGP37231 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGP37231 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms