Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CD40LGP29965 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms