Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARID4AP29374 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARID4AP29374 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms