Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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PTPRMP28827 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPRMP28827 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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