Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SEMA4FO95754 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SEMA4FO95754 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms