Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREB3O43889 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms