Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMAD6O43541 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD6O43541 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD6O43541 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms