Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CACNA1GO43497 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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