Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COCHO43405 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COCHO43405 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms