Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00597Q9H2U6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00597Q9H2U6 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms