Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRACR2AQ9BSW2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms