Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C18orf8Q96DM3 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms