Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ECHDC3Q96DC8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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