Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
MCOLN3Q8TDD5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms