Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HDDC3Q8N4P3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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HDDC3Q8N4P3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HDDC3Q8N4P3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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