Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERC6Q8IVU3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms