Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBE2Q1Q7Z7E8 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms