Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms