Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPOCD1Q6ZMY3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPOCD1Q6ZMY3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms