Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PRAMEF20Q5VT98 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PRAMEF20Q5VT98 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PRAMEF20Q5VT98 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PRAMEF20Q5VT98 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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