Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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