Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms