Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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RTN1Q16799 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RTN1Q16799 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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