Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHRNA2Q15822 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA2Q15822 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA2Q15822 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHRNA2Q15822 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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