Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
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