Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms