Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CAMK2DQ13557 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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