Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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