Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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