Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SRSF5Q13243 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SRSF5Q13243 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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