Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GRIK3Q13003 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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