Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC15Q0P6D6 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms