Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNA1Q09470 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms