Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPN12Q05209 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms