Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FAM3BP58499 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms