Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA7P31268 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA7P31268 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms