Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CNGA1P29973 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms