Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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