Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C4BP0C0L5 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms