Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RHOP08100 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RHOP08100 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RHOP08100 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms