Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSF2P04141 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSF2P04141 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CSF2P04141 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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